Международная школа функциональной геномики и биоинформатики завершилась в СКУ

Международная школа функциональной геномики и биоинформатики завершилась в СКУ, сообщает Законопослушный гражданин. 

В Kozybayev University завершилась третья Международная школа функциональной геномики и биоинформатики. В течение недели преподаватели, студенты и исследователи работали с современными методами анализа геномных данных. От секвенирования и сборки генома до его аннотации и поиска генетических факторов, связанных с хозяйственно ценными признаками растений.

В этом году программа Школы впервые включала практический модуль по полногеномному поиску ассоциаций (GWAS). Этот метод позволяет исследовать связь между генетическими вариантами и признаками организма и используется в современной геномной селекции — в том числе для поиска генов, связанных с урожайностью, качеством зерна и устойчивостью растений к неблагоприятным условиям.

Модуль GWAS провела доктор Мара Микулан из Университета науки и технологий имени короля Абдаллы (KAUST, Саудовская Аравия), специалист по геномике пшеницы и её диких родственников. Участники последовательно прошли основные этапы анализа: от контроля качества данных и оценки структуры популяции до применения статистических моделей и интерпретации кандидатных генов.

Основную часть программы провел профессор Андреа Дзукколо — преподаватель Международного кампуса Kozybayev University и Высшей школы Сант-Анна в Пизе. На практических занятиях слушатели работали с реальными данными генома риса Oryza sativa: выполняли сборку генома, анализ повторяющихся последовательностей, аннотацию и предсказание генов.

Отдельной частью программы стал научный семинар профессора Рода Винга — директора Arizona Genomics Institute Университета Аризоны. Он представил лекцию «Towards a digital genebank for rice to drive AI foundation models for complex trait prediction», посвящённую цифровым генетическим банкам риса и применению моделей искусственного интеллекта для прогнозирования сложных хозяйственно значимых признаков.

Практическая работа проходила на собственной высокопроизводительной вычислительной платформе Kozybayev University. Оснащённой 224 процессорами и 4 ТБ оперативной памяти. За пять дней участники освоили 40 академических часов программы, сочетавшей лекции и практические занятия.

По итогам третьей школы 11 слушателей получили сертификаты о прохождении 40-часового курса. Среди них — представители Казахского НИИ земледелия и растениеводства, Института генетики и физиологии, Института биологии и биотехнологий растений (Алматы), Национального аграрного научно-образовательного центра (Астана), Научно-исследовательского института инновационных технологий при Костанайском региональном университете им.А. Байтурсынова.

«Сегодня геномика становится одним из ключевых инструментов современной селекции. Наша задача — не только развивать собственные исследования, но и создавать в Казахстане среду, где специалисты могут получать практические навыки работы с большими геномными данными и применять их к задачам сельского хозяйства», — отмечают организаторы школы.

Международная школа функциональной геномики и биоинформатики была создана в 2025 году Центром агрокомпетенций Kozybayev University совместно с Arizona Genomics Institute Университета Аризоны. За три школы обучение прошли 35 специалистов и молодых исследователей из Казахстана и других стран.

Первая школа состоялась в октябре 2025 года и объединила 10 участников из Казахстана и Китая. Во второй, прошедшей в мае 2026 года при поддержке Исламской организации по продовольственной безопасности (IOFS), приняли участие 14 слушателей из шести стран. Казахстана, Узбекистана, Кыргызстана, Таджикистана, Азербайджана и Саудовской Аравии.

Таким образом, школа становится регулярной международной образовательной площадкой Kozybayev University в области функциональной геномики и биоинформатики.

Полученные знания связаны с практическими направлениями работы Центра агрокомпетенций — развитием агрогеномики, геномной и ускоренной селекции сельскохозяйственных культур. А также проектом «Геномика национальных достояний», в рамках которого исследуются геномы видов, имеющих значение для Казахстана (Каспийский тюлень, тюльпан Грейга). Подготовленные в рамках Школы специалисты — кадровая база для этих направлений. А также для обеспечения продовольственной безопасности Казахстана.